El documento del CELAM de 1987, "De una Pastoral Indigenista a una Pastoral Indígena," aboga por un cambio radical en el enfoque eclesiástico. Critica el paternalismo de la Pastoral Indigenista tradicional y promueve el surgimiento de una Pastoral Indígena liderada por los propios pueblos originarios. El objetivo es lograr la inculturación de la fe y que la Iglesia tenga "rostro propio" en las culturas de Abya Yala. Esto implica reconocer la revelación divina en las cosmovisiones ancestrales, apoyar la autonomía cultural y los derechos territoriales de los pueblos.